一架隸屬於美國的運輸機墜落到東京灣，恐怖的經歷就此展開…

數日後，接連發生的機械人被襲擊案件，刑事久住武史和助手泰真一郎開始調查此案。在調查過程中，心不在焉的一郎認識了岬?子，對她?生了愛慕。而襲擊事件仍舊繼續發生著，不僅是機械人，連普通人也有數人死於非命。

東京灣內，漁民發現了巨大的不明物體，在得知巴比倫基地發生怪異事件後，兩位刑事趕到基地，卻被一隻巨大的怪物追擊而險些喪命。

此時，而久住武史和泰真一郎也追查到了東都生物醫學研究所，研究所的所長似乎知道整件事情的來龍去脈，他們發現岬?子也是這裏的研究員，她的可疑之處頗多，而一郎也逐漸瞭解到?子悲慘的過去。
經過努力，案情基本得到確認：怪物是實驗室的樣品，代號是「13號」。?了消滅這個怪物，各方決定協同作戰，當13號落入圈套時，?子也選擇了結束生命，而一郎卻無法阻止這一切的發生......

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